Módulo Teórico
- Cribado virtual.
- Bases de datos farmacológicas y proteicas.
- Generación de modelo de farmacóforo.
- Visualizadores moleculares
- Modelamiento molecular.
- Acoplamiento molecular ligando-proteínas
- Dinámica Molecular I y II.
- Propiedades ADMET.
- Reposicionamiento de fármacos.
- Aplicaciones
Módulo Práctico
- Cribado virtual.
- Bases de datos: DrugBank, Zinc, PubChem, NCI Open Chemical Repository, ChemSpace, MolPort, RCSB-PDB, Uniprot.
- Visualizadores moleculares (PyMol)
- Alineamientos estructurales.
- Análisis de interacciones intermoleculares (PLIP).
- Asignación de proyectos de investigación.
- Modelamiento molecular de una proteína.
- Por homología.
- Ab-initio
- Acoplamiento molecular proteína – ligando.
- Preparación de la proteína.
- Preparación del ligando
- Visualizador molecular para análisis de dinámicas (VMD)
- Análisis de dinámicas moleculares.
- RMSD
- RMSF
- Preparación de sistemas para dinámica molecular:
- Solvatación
- Ajuste de la concentración iónica.
- Condiciones periódicas.
- Obtención de representación molecular simplificada (Códigos SMILES)
- Uso de servidores para analizar propiedades ADMET. (SwissADMET)
- Reposicionamiento de fármacos.
- Presentación de proyectos.
